El Gobierno Zapatero ha reforzado la presencia del lobby homosexual en el Consejo de ONGS de Acción Social, incluyendo un vocal en representación de las organizaciones de gays y lesbianas. Por otra parte, se refuerza la presencia gubernamental en su composición aumentando en dos el número de representantes del Ministerio de Trabajo y Asuntos Sociales, e incluyendo un vocal en representación de la Dirección General de Instituciones Penitenciarias del Ministerio del Interior. Además se aumentan en tres vocales los representantes de las ONGs de carácter generalista.
Por otra parte, se pretende reforzar el funcionamiento de la Comisión Permanente mediante la creación de una Vicepresidencia y estableciendo el carácter rotatorio de las ONG en representación de colectivos.